El Plan General de Estudios de la ECEMA, se encuentra inserto en los Decretos 136/00, del 16 de mayo del 2000, Plan General de Estudios de la Escuela de Comando y Estado Mayor Aéreo, y el 72/00, del 22 de febrero del 2000, Plan General de Estudios para Oficiales de Servicios Generales
En ambos Decretos, se establecen los Cursos Regulares, y los Cursos Especiales, así como directivas para el Diseño Curricular, las Reválidas, y disposiciones transitorias.
Estos Decretos se constituyen en parte de la Autoridad para la Reglamentación de la Fuerza Aérea, N° 53-14, del 11 de junio del 2008, donde se establecen las asignaturas, directivas y procedimientos para los Planes Particulares de cada curso.
La Educación Conjunta Militar tiene como base legal el Art. 94 de la Ley 17556. Ejecución de Cuentas y Balance Presupuestal del 01/01/2002.
Las Normas Generales para la Enseñanza de la ECEMA, se encuentran establecidas en la Reglamentación N° 53-15, del 19 de marzo de 1992.La Bibliografìa básica para todos los Cursos, se regirá por la Reglamentación de la Fuerza Aérea 0-1 vigente, la que establece en sus anexos “A” y “B” los Manuales autorizados de uso en la Organización.